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嗅觉刺激任务的fnirs联合机器学习模型可有效诊断认知障碍

  • 发布日期:2023-11-07
  • 阅读量:141
  • 来源:依瑞德集团

全世界每3秒就有一例阿尔茨海默病(ad)新发病例,ad一旦发病便不可逆转,轻度认知功能障碍(mci)是ad的前期症状,因此在mci时期早诊断对治疗关口前移尤为重要。


既往研究表明,嗅觉可用于ad的早期诊断[1-4]。基于这一证据,jaewon kim等通过两项独立的诊断干预实验,使用机器学习算法研究嗅觉刺激下近红外脑功能成像技术(fnirs)的潜在诊断效果[5]


图1 利用原始实验97例被试和附加实验的36例被试数据,建立传统经典模型和机器学习模型并进行验证,右边为两种模型在附加实验中的auc值.


该研究包括先前发表的原始实验(n=97)和一项独立的附加实验(n=34)。


一、原始实验

2021年3月2日至2021年8月30日期间对97名老年志愿者(>60岁)接受嗅觉刺激下眶额叶皮层的fnirs检测、淀粉样蛋白pet成像、脑部mri、载脂蛋白e(apoe)基因分型、简易精神状态量表(mmse)、日常生活能力评估量表(k-iadl)和首尔神经心理学筛查量表(snsb)检测以及医学访谈[6]

二、附加实验

2022年7月22日至2022年8月30日期间纳入了34名老年志愿者(年龄> 60 岁),纳入排除标准及检测项目同原始实验。
  • fnirs检测

7通道双波长fnirs设备,检测眶额叶皮层区域。所有参与者进行两种嗅觉刺激(无味vs薄荷味)下的fnirs测量。40s的基线期,然后嗅觉刺激20s,每个测试重复3次(即3分钟)。


  • 统计分析

以年龄、性别、体重指数(bmi) 、受教育年限、家庭收入、cci(charlson合并症指数)、apoe4载体、mmse结果、snsb结果的z分数(针对年龄教育水平进行标准化)、淀粉样蛋白pet标准摄取值比率以及脑mri的海马体积分数。使用c统计量来表示受试者工作特征曲线(auc)下的平均面积(0-1,值越高表示预测性越好),使用95%的置信区间作为mci和/或ad的预测模型不确定性的度量,可帮助判断模型的稳定性和可靠性。


  • 机器学习模型

首先对数据进行预处理,包括计算每个特征的均值和标准差,并进行归一化处理等。机器学习模型纳入11个特征(fnirs、年龄、性别、家庭收入、吸烟情况、受教育年限、cci、fnirs*受教育年限、fnirs*cci、fnirs*家庭收入、fnirs*年龄)。


下图展示了两个模型的架构。第一个模型是基于轻量级梯度提升(lgb)算法训练模型获得最佳超参数,用于区分mci(不包括ad)和认知正常(cn)。基于优化后的模型,通过对极端梯度提升算法(xgboost)、梯度提升算法(gb)和lgb模型,计算得出mci和cn的概率。第二个模型使用gb和lgb模型的集成方法获得最佳超参数,用于区分mci-ad与cn。通过对gb和lgb模型,计算得出mci-ad和cn的概率。


利用五折交叉验证模型(原始数据集随机分成五个大小相等互斥子集,依次选择四个子集作为训练集,剩下的一个子集作为验证集,使用平衡准确率来评估模型在验证集上的性能),计算出五个模型的平衡精度值,并将其作为交叉验证模型的权重。将五个模型进行加权组合,得出的概率值即为mci和cn (mci-ad和cn) 的最终概率。


图2 两个模型的整体架构

mci和cn的分类使用结合xgboost、gb和lgb三个模型的集成方法,

mci-ad和cn的分类使用结合xgboost、gb、lgb和adaboost四种模型的集成方法。

五倍交叉验证模型的平衡精度值用于交叉验证模型的权重,用以集成模型。

cn: 认知正常; mci: 轻度认知障碍; xgboost: 极端梯度提升算法;

gb: 梯度提升算法;lbg: 轻量级梯度提升算法;adaboost: 自适应增强; ad: 阿尔茨海默病。



三、结果

1、133名受试者中71名cn,41名mci患者,21名ad患者。


2、mci-ad和cn的分类结果,在原始试验和附加试验中,机器学习模型的auc值(0.925、0.825)高于经典统计模型的auc值(0.873、0.639)。mci和cn的分类结果,在原始试验和附加试验中,机器学习模型的auc值(0.860、0.854)高于经典统计模型的auc值(0.852、0.688)。


表1 ad和mci诊断中预测模型的c统计量


3、在两种分类模型的11个特征中,fnirs(嗅觉刺激的眶额叶皮层氧合血红蛋白变化)重要性最高。


图3 11个特征的重要性排名(a) mci-ad和cn的分类; (b) mci和cn的分类。

cn: 认知正常; mci: 轻度认知障碍; ad: 阿尔茨海默病; 

od: 嗅觉刺激的眶额叶皮层氧合血红蛋白变化; 

ss:吸烟状况; hi:家庭收入; ye:受教育年限;

 cci: charlson合并症指数。



四、结论

通过两项独立试验发现,分析嗅觉刺激任务下眶额叶皮层中氧合血红蛋白浓度变化,与经典统计模型相比,机器学习模型在诊断mci和ad方面更具优势。机器学习算法能稳定预测mci和ad患者,普适性高。
fnirs结合机器学习模型可作为mci和/或ad患者潜在的诊断工具。



五、讨论

使用嗅觉刺激的fnirs检测时间短,适合各类人群各种场景,fnirs检测成本较低,且没有ct的辐射暴露和量表测试对文化程度的限制等问题,未来普及性会更好。

这种新方法能够快速诊断mci,为mci患者提供更精准的医疗服务,预防ad。

但是,该模型中受试者种族较为单一,需要纳入更多种族被试验证该模型预测的准确率。

☞ 参考文献:

[1]zhang j, zhao z, sun s, li j, wang y, dong j, yang s, lou y, yang j, li w, et al. olfactory evaluation in alzheimer’s disease model mice. brain sci. 2022;12(5):607.[2]son g, jahanshahi a, yoo sj, boonstra jt, hopkins da, steinbusch hwm, moon c. olfactory neuropathology in alzheimer’s disease: a sign of ongo- ing neurodegeneration. bmb rep. 2021;54(6):295–304.[3]o’connor a, cash dm, poole t, markiewicz pj, fraser mr, malone ib, jiao j, weston psj, flores s, hornbeck r, et al. tau accumulation in autosomal dominant alzheimer’s disease: a longitudinal [(18)f]fortaucipir study. alzheimers res ther. 2023;15(1):99.[4]turri m, conti e, pavanello c, gastoldi f, palumbo m, bernini f, aprea v, re f, barbiroli a, emide d, et al. plasma and cerebrospinal fuid cholesterol esterifcation is hampered in alzheimer’s disease. alzheimers res ther. 2023;15(1):95.

[5]kim j, lee h, lee j, et al. quantification of identifying cognitive impairment using olfactory-stimulated functional near-infrared spectroscopy with machine learning: a post hoc analysis of a diagnostic trial and validation of an external additional trial. [j].alzheimers res ther. 2023;15(1):127.

[6]kim j, yon dk, choi ky, et al. novel diagnostic tools for identifying cognitive impairment using olfactory-stimulated functional near-infrared spectroscopy: patient-level, single-group, diagnostic trial. [j]. alzheimers res ther. 2022;14(1):39. 


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